新生兒便祕是一種常見病症，指大便乾硬，隔時較久，有時排便困難。單純性便祕多因結腸吸收水分電解質增多引起。
新生兒(指出生後不滿28天)便祕的原因大多為：
人工餵養：牛奶經消化所含的皂鈣較多，易引起大便乾結，從而便祕。
乳量不足：如果吃奶吃得少，或嘔吐較多，或進食補液的小兒可引起暫時性的無大便。另外，新生兒的消化道肌層發育尚不完全，這樣易引起便祕，還可同時伴有吐奶。只要小兒體重不下降，嘔吐和便祕的現象都是正常的。
外科性疾病：可能的畸形包括腸道閉鎖、腸狹窄、腸旋轉不良、先天性巨結腸、先天性無肛、骶尾部脊柱裂、脊膜膨出、腫瘤壓迫馬尾部神經等，這些疾病常伴有嚴重的嘔吐和腹脹的現象，需及時診治。
值得注意的：新生兒幾天不大便不一定是便祕
新生兒由於解便機制未發育成熟，所以無法定時解便，常常要大便積多，直腸壁的神經感受到膨脹壓力，引發反射性的解出，這就是有些嬰兒幾天才解一次大便的原因，用温度計刺激，因為可引發反射，所以也可以使其解便。
吃母奶的小孩，由於母奶吸收較完全，大便量較少，有些嬰兒反而會好幾天才解一次便，不一定隨吃隨解。所以，新生兒幾天不大便不一定是便祕，判斷新生兒是否便祕的方法是觀察大便性狀，如果性狀正常，幾天不大便也屬正常。
正常新生兒的大便什麼樣：
母乳餵養的小寶寶的大便是黃色或金黃的，稠度均勻，藥膏狀，可有小顆粒，偶爾稍稀薄，可以帶少量綠色。如果奶中所含的碳水化合物較多，即我們平時所説的糖類較多，在腸道中發酵，使得大便柔軟，並且含有很多的泡沫，可以使大便的次數增多。
人工餵養的新生兒，若以牛奶餵養為主，大便為淡黃，質地可以較乾燥，可有明顯的臭味，這是因為牛奶中含有高蛋白，分解時較臭。大便中可有白色奶塊，這是因為牛奶中含大量絡蛋白，消化時易於與鈣結合形成皂鈣的緣故。
